011-2011

MO640 - Biologia Computacional - Questão Oral

Número: 011

Enunciado:

Existem diversas ferramentas e técnicas para a busca de sequências em bases de dados. Escolha a afirmação incorreta dentre os itens a seguir:

1. Em uma tal busca, uma sequência deve ser comparada com todas as sequências já existentes na base. Dada a complexidade quadrática dos métodos comuns, isto torna impraticável usá-los nas buscas em bases de dados muito grandes. Pensando nisto, novos métodos foram desenvolvidos para pesquisa nestas bases de dados, como por exemplo o "Basic Local Alignment Search Tool".
2. Para construir-se uma matriz PAM adequada à comparação de sequências distantes uma unidade de evolução, precisa-se de: (i) uma lista de mutações aceitas e (ii) as probabilidades de ocorrência de cada aminoácido.
3. Todas as matrizes PAM para distâncias diferentes de uma unidade de evolução entre proteínas são construídas a partir da matriz 1-PAM.
4. O método BLAST retorna uma lista de pares de segmentos de pontuação alta resultantes da comparação entre a sequência de busca e as sequências presentes na base de dados.
5. NDA

  Ideia original de: Kaio Karam