Número: 067
Enunciado:
Por que o genoma da bactéria Neisseria meningitidis é interessante para se testar a eficiência de um montador:
- Por que é um dos mais simples e fáceis de se compreender dos genomas completos
- Por que é um dos mais difíceis de montar e rico em repeats que já foi completado.
- Por que é extremamente longo, perto do tamanho do genoma humano.
- Por que é rico em erros de leitura, e possui muitos reads de baixa qualidade.
- NDA
Resposta: B
ResponderExcluirDe acordo com o que foi discutido em sala de aula, e com o paper “Fragment assembly with short reads”, para testar um montador necessitaríamos de um genoma completamente mapeado. Além disto, para um dado genoma, enquanto o número de overlapping reads está linearmente relacionado com o tamanho dos reads, o número de repeat pairs aumentou drasticamente no genoma da Neisseria meningitidis, a qual é, segundo o texto, maior e mais complexo.
Caro Michel,
ResponderExcluirVocê está na direção certa, mas precisa melhorar um pouco. Você pegou do paper esta frase que diz sobre o número de overlapping reads e repeat pairs, mas tirou-a de seu contexto, que é o de simulação com projetos hipotéticos, e ela perdeu um pouco o sentido.
Seria melhor dizer simplesmente que Neisseria tem muito mais repeats do que a média dos outros genomas conhecidos de tamanho comparável.
Nota 8,0 (oito).