quinta-feira, 3 de fevereiro de 2011

017-2007

MO640 - Questão para a prova oral
Número: 017
Enunciado:
Sobre as distâncias calculadas pelos modelos de Kimura e Jukes-Cantor, podemos afirmar que:
  1. Se entre as seqüências houver apenas transições, teremos valores iguais.
  2. Se entre as seqüências houver número igual de transições e transversões, teremos valores iguais.
  3. Se entre as seqüências o número de transversões for exatamente o dobro do número de transições, teremos valores iguais.
  4. Se entre as seqüências o número de transições for exatamente o dobro do número de transversões, teremos valores iguais.
  5. NDA
Autor(a): Daniel Ivasse

3 comentários:

  1. Distância de Jukes-Cantor:
    dj = -3ln(1 - 4p/3)/4

    Distância de Kimura:
    dk = -ln(1 - 2P - Q)/2 - ln(1 - 2Q)/4

    Onde:
    p = nd/n; P = ns/n; Q = nv/n
    ns = número de transições entre as duas sequências
    nv = número de transverções entre as duas sequências
    nd = ns + nv

    A. Nesse caso, p = P e Q = 0. Teremos:
    dj = -3ln(1 - 4P/3)/4 e
    dk = -ln(1 - 2P)/2
    Portanto, as distâncias são diferentes.

    B. Nesse caso, P = Q e p = 2P. Teremos:
    dj = -3ln(1 - 8P/3)/4 e
    dk = -ln(1 - 3P)/2 - ln(1 - 2P)/4
    Portanto, as distâncias são diferentes.

    C. Nesse caso, Q = 2P e p = 3P. Teremos:
    dj = -3ln(1 - 4P)/4 e
    dk = -3ln(1 - 4P)/4
    Portanto, as distâncias são iguais.

    D. Nesse caso, P = 2Q e p = 3Q. Teremos:
    dj = -3ln(1 - 4Q)/4 e
    dk = -ln(1 - 5Q)/2 - ln(1 - 2Q)/4
    Portanto, as distâncias são diferentes.

    Logo, a alternativa correta é a C.

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  2. Kaio,

    Ótimo comentário, muito preciso e claro. Nota 9,5. Faltou apenas dizer quem é n.

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  3. Nossa! Que droga, esqueci do n :-(

    Bom, só pra deixar o comentário completo,
    n = número de posições (bases) em cada uma das duas sequências.

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