062-2007

MO640 - Questão para a prova oral
Número: 062
Enunciado:
Assinale a afirmativa incorreta sobre o artigo "A Simple Toolkit for DNA fragment assembly":

1. O autor utiliza a técnica de hashing na fase de pré-processamento para diminuir o número de comparações necessárias para a obtenção dos pares de fragmentos.
2. O parâmetro "WINDOW" se utilizado corretamente evita que o número de janelas comuns seja muito grande o que prejudicaria a velocidade do método proposto.
3. A fase de pós-processamento recebe como entrada um contig e retorna um alinhamento múltiplo de fragmentos e uma sequência de consenso.
4. Um dos pontos fracos do algoritmo é o tratamento de sequências que aparecem repetidas em diversos trechos do genoma.
5. NDA

Autor(a): Carlos Henrique Benini dos Santos